Bifidobacterium bifidum

Orn-dominant stems, minor Lys variants, Ser-Asp bridges; these are not the adolescentis Lys–D-Asx model.

BbMep cuts stem 2→3. Soluble glycan-dipeptide release also requires muramidase; mutanolysin does not cut the peptide.

Tested non-crosslinked monomers were not BbMep substrates. Do not extrapolate to every NlpC/p60 homolog.

肽干以 Orn 为主，含少量 Lys 变体和 Ser-Asp 桥；不能套用 adolescentis 的 Lys–D-Asx 模型。

BbMep 切肽干 2→3 位。释放可溶性糖-二肽还需胞壁质酶；mutanolysin 不切肽键。

测试的非交联单体不是 BbMep 底物；不可外推到所有 NlpC/p60 同源物。

Predominan tallos con Orn, con variantes minoritarias de Lys y puentes Ser-Asp; no equivalen al modelo Lys–D-Asx de adolescentis.

BbMep corta el tallo 2→3. Liberar glicano-dipéptidos solubles requiere además muramidasa; la mutanolisina no corta el péptido.

Los monómeros no entrecruzados ensayados no fueron sustratos de BbMep. No extrapolar a todo homólogo NlpC/p60.

Sources / 来源 / Fuentes

Biochemical characterization of Bifidobacterium bifidum peptidoglycan d,l-endopeptidase BbMep that generates NOD2 ligands
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Locator / 定位 / Localización: Figures 1–2; Results: sacculi activity and monomer substrate boundary; Figure S8. ATCC 15696 proteome used for BbMep identification.
In silico MS/MS prediction for peptidoglycan profiling uncovers novel anti-inflammatory peptidoglycan fragments of the gut microbiota
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Locator / 定位 / Localización: Figures 4B, 5 and S8B: species-specific PGN profiles.